نشر نی با کوشش جعفر همایی و تنی چند از دوستانش در سال ۱۳۶۴ متولد شد. جعفر همایی پس از مصادره‌ی انتشارات امیرکبیر، مدتی در آن نشر مدیر تولید بود و پس از جدایی از آن، به فکر تأسیس یک نشر می‌افتد. او را کسانی چون جلال رفیع، سید احمد سام، احمد ستاری، عبدالعلی رضایی و منصور آسیم همراهی می‌کنند و با گذاشتن هر نفر ده هزار تومان سرمایه‌ی اولیه‌ی نشر فراهم می‌شود. اینکه چطور این افراد نام نشر را انتخاب کردند، همایی گفته: «روزی در خانه‌ی بنده جلسه داشتیم، درباره‌ی کارهای شرکت صحبت می‌کردیم که نوای نی از بیرون آمد. رفتم بیرون و دیدم پیرمردی زیر پنجره نشسته و مشغول نی زدن است. پیرمردی ملایری بود که دعوتش کردم به داخل خانه. برایمان نی زد و جلال رفیع که صدای خوشی دارد شروع کرد به خواندن شعر بزن نی را دلم غم دارد امشب. به هر حال پیشنهاد نام نی بعد از چند جلسه توسط جلال رفیع داده شد.» نخستین کتاب نشر نی حقایق الاخبار ناصری به تصحیح مرحوم خدیو جم بود و این نشر در دهه‌ی هفتاد با انتشار عناوینی در حوزه‌های سیاست و جامعه و فلسفه به یکی از ناشران مهم درآمد.