«بیداری در باغ مومیایی» پژوهشی مقایسهای در شناخت شاهنامه فردوسی و «غرر اخبار الملوک الفرس و سیرهم» مشهور به تاریخ ثعالبی است. دریافت معانی بلند شاهنامه از یکسو در گرو آشنایی با منطق اسطوره و از دیگر سو، مستلزم پژوهش تطبیقی شاهنامه و مقایسه آن با آثار دیگری است که در آنها از داستانهای حماسی ایران سخن رفته است.از محمدجعفر محمدزاده پیش از این کتابهای «اسفندیارنامه» «تکبیتهای حافظ»، «در فراسوی زمان»، «از منزل کفر تا به دین»، «گفتار حکیم» و «هستی و زبان» در پیوند با رشته تحصیلیاش منتشر شده است. علاوه بر این کتابهای «رسانه شناخت» و «روزهای انتخاب» نیز در ارتباط با حرفه روزنامهنگاری و تجربه مدیریتی او در عرصه رسانه به چاپ رسیده است.
